ניקוי מס במקור הוא המקרה שבו הלקוח משלם למס הכנסה במקומכם. נניח לצורך העניין שלקוח עסקי הזמין מכם עבודה והיה אמור לשלם לכם עליה 2,000 ₪, וששיעור מס ההכנסה מהעסקה הזו הוא 5% - הלקוח ישלם לכם 1,900 ₪, ויעביר בשמכם למס הכנסה 100 שקלים. ניקוי מס במקור רלוונטי רק במקרה של לקוחות עסקיים, כמו עוסקים מורשים או חברות, כך שאם אתם עובדים רק מול לקוחות פרטיים כנראה שהנושא לא נוגע לכם.

חשוב לבקש מהלקוח אישור ניקוי מס במקור ולשמור אותו לצורך הדיווח השנתי למס הכנסה. אם לא תשמרו אישורי ניקוי מס במקור יכול להיות שתשלמו מס פעמיים, וחבל. אפשר להגיש בקשה לפטור מניקוי מס במקור. אם אתם עסקים עם וותק של יותר משנה ואין לכם היסטוריה של התחמקות מתשלום מס, מס הכנסה יאשרו לכם את הבקשה ברוב המקרים. עם זאת, עסקים בתחומים החייבים בניקוי מס במקור כמו קבלני בנייה, טכנאי חשמל ואלקטורניקה, מובילים וכו' לא יקבלו אישור לפטור מניקוי מס במקור אף פעם.